بررسی هومولوژی ژن alt a 1 در آلترناریا های جداسازی شده از هوای تهران

پایان نامه
چکیده

گونه های آلترناریا بخش مهمی از فلور قارچی موجود در محیط هستند که در همه جا بویژه در هوا، خاک، آب و ترکیبات آلی در حال فساد یافت می شوند. این قارچ ها به عنوان یکی از شایع ترین عوامل ایجاد کننده آلرژی در انسان مطرح بوده و ارتباط نزدیکی با ایجاد آسم و انواع دیگر ازدیاد حساسیت در انسان دارند. از مهمترین آلرژن های آلترناریا پروتئینی به نام alt a1 است که عمدتا توسط آلترناریا آلترناتا تولید میشود. در تحقیق حاضر، توالی ژن alt a1 با هدف بررسی میزان همولوژی ژن مذکور و ارتباط اجدادی 48 ایزوله آلترناریا جداسازی شده از نمونه هوای مناطق 22 گانه شهر تهران شامل آلترناریا آلترناتا (16 ایزوله) ، آلترناریا سولانی (11 ایزوله)، آلترناریا تنوئیسیما (11 ایزوله)، آلترناریا پوری (8 ایزوله) و آلترناریا براسیسیکولا (2 ایزوله) تعیین و مورد مقایسه قرار گرفت. دندروگرام حاصل از آنالیز توالی ژن مذکور نشان داد که گونه ها و ایزوله های آلترناریا در دو شاخه اصلی با 7 و 3 زیر شاخه طبقه بندی گردیدند. قرابت داخل گونه ای بالایی در میان گونه های مورد بررسی گزارش گردید و اکثر ایزوله های مربوط به یک گونه از قرابت بالای 90 درصد برخوردار بودند. اکثر ایزوله های آلترناریا آلترناتا (با 99% قرابت)، آلترناریا سولانی (با 99% قرابت)، آلترناریا تنوئیسیما (با 99% قرابت) و آلترناریا پوری (با 99% قرابت) در زیر شاخه های مربوط به یک گونه قرار گرفتند. هر چند اختلافاتی در جایگاه یک ایزوله آلترناریا پوری taap-3 (با 99% قرابت) با گونه های آلترناتا، سولانی و تنوئیسیما مشاهده گردید. همچنین تفاوتهایی در جایگاه دو ایزوله آلترناریا سولانی شامل taas-3 (با 99% قرابت) با زیر شاخه متعلق به ایزوله ها ی آلترناریا تنوئیسیما و taas-4 (با 99% قرابت) با زیر شاخه متعلق به ایزوله های آلترناریا آلترناتا و آلترناریا تنوئیسیما مشاهده گردید. اکثر ایزوله های آلترناریا آلترناتا و آلترناریا تنوئیسیما در دو زیر شاخه با درصد قرابت 99 و 59 قرار گرفتند و تنها دو سوش آلترناریا آلترناتا شامل taaa-13 و taaa-10 در دو زیر شاخه جدا از هم طبقه بندی شدند. در رابطه با دو ایزوله آلترناریا براسیسیکولا تفاوت چشمگیری در جایگاه فیلوژنیک مشاهده گردید. این ایزوله ها هر یک در زیر شاخه ای مجزا در یکی از شاخه های اصلی قرار گرفتند و میزان قرابت ایزوله taab-1 با ایزوله های متعلق به آلترناریا آلترناتا، آلترناریا سولانی و آلترناریا تنوئیسیما حدود 54% و قرابت ایزوله taab-2با ایزوله های متعلق به الترناریا پوری حدود 99% گزارش گردید. نتایج بدست آمده در تحقیق حاضر اهمیت گونه های آلترناریا را بعنوان یکی از گروه های مهم قارچ های آئروآلرژن مورد تاکید قرار داده و نشان داد که تعیین توالی ژن alt a1 میتواند برای ارزیابی وابستگی اجدادی ایزوله های منعلق به گونه های اصلی آلترناریا بسیار مفید و کارامد باشد. ارزیابی نقش گونه های آلترناریای مورد بررسی در تحقیق حاضر در اتیولوژی آسم و آلرژی در سطح جمعیت توصیه شده و میتواند در اتخاذ راهکارهای موثر کنترل و درمان موارد بیماری های مذکور راهگشا باشد.

منابع مشابه

ارزیابی حضور و تنوع ژن Alt a 1 در آلترناریاهای جداسازی شده از هوای تهران

زمینه و اهداف: در تحقیق حاضر، الگوی پراکندگی و فیلوژنی گونه های آلترناریای جدا شده از هوای تهران بر اساس حضور و تنوع ژن Alt a1 مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش کار: تعداد 48 جدایه آلترناریا  متعلق به گونه های آلترناریا الترناتا (33/4%)، آلترناریا سولانی (23%)، آلترناریا تنئوایسیما (23%)، آلترناریا پوری (16/6%) و آلترناریا براسیکولا (4%) جداسازی شده از نمونه های هوای شهر تهران در پلیت های سابورو...

متن کامل

ارزیابی حضور و تنوع ژن alt a ۱ در آلترناریاهای جداسازی شده از هوای تهران

زمینه و اهداف: در تحقیق حاضر، الگوی پراکندگی و فیلوژنی گونه های آلترناریای جدا شده از هوای تهران بر اساس حضور و تنوع ژن alt a1 مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش کار: تعداد 48 جدایه آلترناریا  متعلق به گونه های آلترناریا الترناتا (33/4%)، آلترناریا سولانی (23%)، آلترناریا تنئوایسیما (23%)، آلترناریا پوری (16/6%) و آلترناریا براسیکولا (4%) جداسازی شده از نمونه های هوای شهر تهران در پلیت های سابورو...

متن کامل

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

بررسی حضور ژن prf A در لیستریا مونوسیتوژنز جداسازی شده از مواد غذایی

  زمینه: لیستریا باکتری گرم مثبت و درون سلولی اختیاریست که از طریق غذا انتقال می­یابد. ژن prf A تنظیم­کننده بیان سایر ژن­های بیماری­زاست و در بیماری­زایی باکتری نقش دارد.   هدف: مطالعه به منظور تعیین حضور ژن prf A در لیستریا مونوسیتوژنز جداسازی شده از مواد غذایی مختلف انجام شد.   مواد و روش­ها: این مطالعه تحلیلی در سال 1391 بر روی 212 نمونه غذایی مختلف جمع­آوری شده از شهرهای مختلف انجام شد. لیس...

متن کامل

ارزیابی ژن actA در لیستریا مونوسیتوژنز جداسازی شده از لبنیات

سابقه و هدف: : لیستریا باکتری گرم مثبت و درون سلولی اختیاری است. یکی از مهم ترین ژن های این باکتری actA می باشد که موجب حرکت باکتری در سلول میزبان و در نتیجه بیماری زایی آن می گردد. این مطالعه با هدف ارزیابی حضور ژن actA در سویه های لیستریا مونوسیتوژنز جداسازی شده از فرآورده های لبنی انجام شده است. مواد و روش ها: این پژوهش به صورت مقطعی-توصیفی بر روی 70 نمونه جمع آوری شده از فرآورده های لبنی م...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023